MXNET Dependency Engine

Table of Contents

基本背景知识

MXNET中有一个依赖引擎,这个引擎是用来分析计算过程的依赖关系,把不依赖的计算并行 化,以达到提高性能的目的。它的基本原理可以看官方的文档。 简单的说就是给每一个对 象打上一个tag,这个tag叫做Var,每一个计算(op)都会依赖一个或者多个Var,依赖有两种 类型:写依赖和读依赖。依赖引擎为每一个Var都维护一个队列,然后根据op的依赖关系向 队列中添加ReadDependency和WriteDependency,当各个依赖完成后要更新队列的状态。

Op

Op实际上是用来代表计算过程以及它依赖的var,先来看看它的uml类图。

opr-class-uml.png

上面一些比较重要的属性如下:

  1. fn: op实际要执行的函数
  2. const_vars, mutable_vars: 依赖的var列表(读和写)。
  3. wait: 当前还没有就绪的var的个数,它的初始值是 len(const_vars)+len(mutable_vars), 每一个依赖就绪那么就会调用 dec_wait 将 该值减一,如果该值为0,那么所有的依赖都已就绪,那么可以丢到执行引擎执行了。

Var

var可以看做是一个tag,用来标示每一个对象的,这样Op对对象的依赖可以简化成对var的 依赖,这样就可以构建出一个不依赖于具体的对象的通用的依赖引擎。Var是依赖引擎的关键。

类图

threaded-var-class-uml.png

声明:下文说到执行时,意思是Op的当前var的依赖已经就绪,因为一个op可以依赖多个 var,如果其他的Var没有就绪,那么这时op可能并没有实际运行

Var只是一个基类,用来统一类型系统的,主要的工作在 ThreadedVar 中,每一个对象都 会有一个由 VersionedVarBlock 所组成的链表,这个链表就是一个FIFO队列。 head_ 指向的是队列的尾部, 实际是一个哨兵(空对象), head_ 这个命名有误导性, pending_write_ 指向的是最"老"的写依赖,如果没有写依赖,那么就指向 nullptr, 根据依赖引擎的特点,它实际上指向的是队列的头部, ThreadedVar 的那四个方法就是 来操作这个队列的。

  1. num_pending_reads_: 代表当前正在执行(还没有执行完)的读依赖的个数
  2. pending_write_: 代表队列中最“老”的写依赖, 它一直指向队列的头部。
  3. head_: 队列的尾部。

需要注意的是,正在执行的读依赖是不在队列中的,但是正在执行的写依赖是在队列中的。

理解Var的队列

var的队列是依赖引擎的核心,下面我们来分析下各种情况下,如何修改队列的状态。

  1. 添加读依赖: 如果前面没有写依赖,那么直接运行, 否则就插入队列的尾部(head_那一端)
  2. 添加写依赖: 直接将依赖插入队列的尾部,并检查是不是写就绪(既没有读依赖也没有 写依赖在运行),如果是写就绪,那么就运行该依赖。
  3. 读依赖完成
  4. 写依赖完成

threaded-var-queue1.png

上图中w1写依赖正在执行。

threaded-var-queue2.png 写依赖w1完成将自己移出队列,并执行写依赖w2

threaded-var-queue3.png

写依赖w2完成后将自己移出队列,接着并行的执行读依赖r1,r2,记住正在执行的读依赖是被移出队列的, 它们的数目使用 num_pending_reads_ 跟踪的

threaded-var-queue4.png

每一个读依赖完成都会将 num_pending_reads_ 减一,如果减为了0,那么就意味着所有 的读依赖都完成了,当r1,r2都完成后,接着执行w3写依赖。

添加读依赖

代码主要在 src/engine/Threaded_engine.ccAppendReadDependency 中。

inline void ThreadedVar::AppendReadDependency(OprBlock* opr_block) {
    std::lock_guard<std::mutex> lock{m_};
    if (pending_write_ == nullptr) {
        // invariant: is_ready_to_read()
        CHECK_GE(num_pending_reads_, 0);
        // STATE CHANGE
        ++num_pending_reads_;
        // decrease wait counter
        opr_block->decr_wait();
    } else {
        auto&& new_var_block = VersionedVarBlock::New();
        assert(head_->next == nullptr);
        assert(head_->trigger == nullptr);
        assert(head_->write == false);
        // append things to next.
        head_->next = new_var_block;
        head_->trigger = opr_block;
        head_ = new_var_block;
    }
}

代码的基本思路是这样的:检查队列中有没有写依赖,这分两种情况:

  1. 如果没有写依赖,那么意味着,目前该Var没有依赖在执行,或者说只有读依赖在执行, 所以这个新的读依赖可以直接执行,那么它没有必要添加到队列中,只需要更新 num_pending_reads_ 就好,当然因为该op可能还依赖别的var,所以你只能调用 decr_wait ,只有当wait减为0的时候,才能开始运行。这部分代码在engine的push中。
  2. 如果有写依赖,那么读依赖必须在写依赖的后面执行,所以需要把读依赖添加到队列的 尾部。记住 head_ 永远指向一个空的哨兵对象。

添加写依赖

代码主要在 src/engine/Threaded_engine.ccAppendWriteDependency 中。

inline void ThreadedVar::AppendWriteDependency(OprBlock* opr_block) {
    auto&& new_var_block = VersionedVarBlock::New();
    std::lock_guard<std::mutex> lock{m_};
    // invariant.
    assert(head_->next == nullptr);
    assert(head_->trigger == nullptr);
    assert(head_->write == false);
    // attach to head.
    head_->next = new_var_block;
    head_->trigger = opr_block;
    head_->write = true;

    // check if it is ready to write
    if (pending_write_ == nullptr) {
        // invariant: is_ready_to_read()
        pending_write_ = head_;
        CHECK_GE(num_pending_reads_, 0);
        if (num_pending_reads_ == 0) {
            // STATE CHANGE
            opr_block->decr_wait();
            num_pending_reads_ = kWriteTriggered;
        }
    } else {
        CHECK_NE(num_pending_reads_, 0);
    }
    head_ = new_var_block;
}

代码的基本思路是这样的: 将该Op放入队列的尾部,接着检查该Op的依赖有没有就绪,这 要检查Var有没有写依赖(pending_read_==nullptr)和读依赖(num_pending_read_==0)的Op 正在执行,只有二者都没有时,才能开始运行,当然你依然要检查该Op对其他的Var的依赖 有没有就绪。需要注意的一点是,即便Op的Var写依赖就绪,该Op也不会从队列中移除,只 有该Op执行完成后才会被移除,这在CompleteWriteDependency中实现。

读依赖完成

代码主要在 src/engine/Threaded_engine.ccCompleteReadDependency 中。

template <typename Dispatcher>
inline void ThreadedVar::CompleteReadDependency(Dispatcher dispatcher) {
    OprBlock *trigger = nullptr;
    {
        // this is lock scope
        std::lock_guard<std::mutex> lock{m_};
        CHECK_GT(num_pending_reads_, 0);

        if (--num_pending_reads_ == 0) {
            if (pending_write_ != nullptr) {
                // STATE CHANGE
                trigger = pending_write_->trigger;
                num_pending_reads_ = kWriteTriggered;
            }
        }
    }
    if (trigger != nullptr && trigger->decr_wait() == 0) {
        dispatcher(trigger);
    }
}

该部分代码会在一个op运算完成后调用,代码逻辑是比较简单的,先更新 num_pending_read_, 更新后如果该值为0,那么就意味着,所有的读依赖都已经执行完成, 这样就检查队列,若是存在写依赖,那么该写依赖就就绪了,那么Op就可以执行了(前提是 依赖的其他var也都就绪了, wait为0)。上面的dispatcher实际就是用来将Op丢入执行引擎 的,它一般是PushToExecute,这个后文会看到。

写依赖完成

代码主要在 src/engine/Threaded_engine.ccCompleteWriteDependency 中。

template <typename Dispatcher>
inline bool ThreadedVar::CompleteWriteDependency(Dispatcher dispatcher) {
  // this is lock scope
  VersionedVarBlock *old_pending_write, *end_of_read_chain;
  OprBlock* trigger_write = nullptr;
  {
    std::lock_guard<std::mutex> lock{m_};
    // invariants
    assert(head_->next == nullptr);
    assert(pending_write_ != nullptr);
    CHECK_EQ(num_pending_reads_, kWriteTriggered);

    // really delete
    if (to_delete_) {
      VersionedVarBlock *head = pending_write_->next;
      VersionedVarBlock::Delete(pending_write_);
      assert(head_ == head);
      VersionedVarBlock::Delete(head);
      return true;
    }
    // detach pending write
    old_pending_write = pending_write_;
    // search for chains to trigger
    end_of_read_chain = old_pending_write->next;
    // reset to 0 pending reads
    num_pending_reads_ = 0;
    while (end_of_read_chain != head_ &&
           end_of_read_chain->write == false) {
      ++num_pending_reads_;
      end_of_read_chain = end_of_read_chain->next;
    }
    if (end_of_read_chain == head_) {
      pending_write_ = nullptr;
    } else {
      // check if there is pending reads, if not trigger write
      assert(end_of_read_chain->write == true);
      pending_write_ = end_of_read_chain;
      if (num_pending_reads_ == 0) {
        // mark write as already actived in this var
        num_pending_reads_ = kWriteTriggered;
        trigger_write = end_of_read_chain->trigger;
      }
    }
  }
  // This is outside of lock scope
  // Be very carful, pending_write_ and num_pending_reads_
  // can change now, do not reply ont the two variables.
  // The linked list \in [old_pending_write, end_of_read_chain)
  // is already detached from this Var.
  // So it is safe to modify these
  VersionedVarBlock *cur_head = old_pending_write->next;
  VersionedVarBlock::Delete(old_pending_write);
  // dispatch all the events
  while (cur_head != end_of_read_chain) {
    if (cur_head->trigger->decr_wait() == 0) {
      dispatcher(cur_head->trigger);
    }
    auto prev = cur_head;
    cur_head = cur_head->next;
    assert(cur_head != nullptr);
    VersionedVarBlock::Delete(prev);
  }
  if (trigger_write != nullptr && trigger_write->decr_wait() == 0) {
    dispatcher(trigger_write);
  }
  return false;
}

和读依赖完成类似,只是写依赖的后面可能跟着多个读依赖,所以需要遍历链表直到发现下 一个写依赖, 这个写依赖由 end_of_read_chain 指针来表示,如果没发现写依赖,那么 该指针指向 head_,遍历的过程中每发现一个读依赖就将 num_pending_reads_ 加一, 这样当遍历结束后, old_pending_write 指向已经完成的写依赖,而 end_of_read_chain 指向下一个写依赖或者 head_, 这时候有两种情况:

  1. 这两个指针的中间有多个元素,很显然这是多个读依赖,第二个 while 循环就是用来 并行的执行这两个指针中间的读依赖的。
  2. 这两个指针之间没有元素,那么意味着没有读依赖,那么就直接执行 end_of_read_chian 指向的写依赖,如果该指针指向 head_ 那么意味着队列为空, 什么也不用做。 最后 一部分的 if 就是用来处理这个情况的。

Engine

Engine是总的调用接口。

void ThreadedEngine::Push(OprHandle op, Context exec_ctx, int priority) {
    ThreadedOpr* threaded_opr = ThreadedOpr::CastFromBase(op);
    OprBlock* opr_block = OprBlock::New();
    opr_block->opr = threaded_opr;

    opr_block->wait.store(static_cast<int>(
                              threaded_opr->const_vars.size() +
                              threaded_opr->mutable_vars.size() + 1));
    opr_block->ctx = exec_ctx;
    opr_block->priority = priority;
    ++pending_;
    // Add read dependencies.
    for (auto&& i : threaded_opr->const_vars) {
        i->AppendReadDependency(opr_block);
    }
    // Add write dependencies.
    for (auto&& i : threaded_opr->mutable_vars) {
        i->AppendWriteDependency(opr_block);
    }
    if (opr_block->decr_wait() == 0) {
        this->PushToExecute(opr_block, true);
    }
}

代码是比较清楚的,主要是 AppendReadDependencyAppendWriteDependency 的部 分,实际上就是把op加到它所依赖的Var的队列中, 最后检查wait是不是为0,如果为0,那 么意味着所有依赖都已经就绪,可以直接扔到执行引擎上执行了(PushToExecute),对于不同 的执行引擎, PushToExecute 的实现是不一样的。最终都会执行 ExecuteOprBlock.

void ExecuteOprBlock(RunContext run_ctx, OprBlock *opr_block) {
    ThreadedOpr* threaded_opr = opr_block->opr;
    CallbackOnComplete callback = this->CreateCallback(
        ThreadedEngine::OnCompleteStatic, threaded_opr);
    bool debug_info = (engine_info_ && debug_push_opr_ == opr_block);
    if (!shutdown_phase_) {
      try {
        threaded_opr->fn(run_ctx, callback);
      } catch(dmlc::Error &e) {
        std::string what = e.what();
      }
    } else {
      callback();
    }

    OprBlock::Delete(opr_block);
  }

上述代码实际就是执行op中的函数,同时在结束的时候运行 OnCompleteStatic.

void ThreadedEngine::OnCompleteStatic(
    Engine *engine, void *threaded_opr) {
  static_cast<ThreadedEngine*>(engine)->OnComplete(
      static_cast<ThreadedOpr*>(threaded_opr));
}

显然, OnCompleteStatic 就是执行 OnComplete。

inline void ThreadedEngine::OnComplete(ThreadedOpr* threaded_opr) {
  // Mark complete for read variables
  for (auto&& i : threaded_opr->const_vars) {
    i->CompleteReadDependency([this](OprBlock* opr) {
        this->PushToExecute(opr, false);
      });
  }
  // Mark complete for write variables.
  for (auto&& i : threaded_opr->mutable_vars) {
    bool debug_info = (engine_info_ && debug_wait_var_ == i);
    if (debug_info) {
      LOG(INFO) << "Complete write dep for " << i;
    }
    bool to_delete = i->CompleteWriteDependency(
        [this, debug_info](OprBlock* opr) {
          if (debug_info) {
            LOG(INFO) << "PushToExecute " << opr;
            debug_push_opr_ = opr;
          }
          this->PushToExecute(opr, false);
          if (debug_info) {
            LOG(INFO) << "Fin PushToExecute " << opr;
          }
        });
    if (to_delete) {
      ThreadedVar::Delete(i);
    }
  }
  int npending;
  {
    std::unique_lock<std::mutex> lock{finished_m_};
    npending = --pending_;
  }
  CHECK_GE(npending, 0);
  if (npending == 0) {
    // no need to grab lock when notify.
    finished_cv_.notify_all();
  }

  // delte operator if it is temperory
  if (threaded_opr->temporary) {
    ThreadedOpr::Delete(threaded_opr);
  }
}

这个函数实际上就是Op完成后用来更新Var的队列的,在内部会调用每一个读依赖的 CompleteReadDependency 以及写依赖的 CompleteWriteDependency, 注意上面传递给 CompleteReadDependencyCompleteWriteDependency 的匿名函数(dispatcher)中主 要是调用了 PushToExecute.

总结

通过 Push 将Op的各种依赖加入相应的Var的队列,并且当依赖都满足的时候将op丢入执 行引擎执行,当执行引擎完成后,调用 Complete 系列的函数来更新Var的队列,在更新队 列的过程中,它又会将依赖就绪的Op丢入执行引擎执行,这样一直循环,直到所有的计算过 程都完成。